bigmemoryExtras

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigmemoryExtras

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大内存包的扩展，增加了安全性、便利性和因子类

Bioconductor版本:发行版(3.13)

这个包定义了一个"BigMatrix"引用类，它为bigmemory包中的filebacked.big.matrix类添加了安全和方便的特性。BigMatrix通过监视和优雅地恢复到磁盘上数据的连接来防止段错误，它还通过基于文件系统的权限系统防止意外的数据修改。我们提供了在Biobase包的eSet类家族中使用bigmatrix派生类作为assayData矩阵的实用程序。BigMatrix提供了一些与附加和索引带有dimnames的文件支持矩阵相关的优化。此外，该包还提供了一个“BigMatrixFactor”类，这是一个具有因子属性的文件支持矩阵。

作者:Peter M. Haverty

维护者:Peter M. Haverty < phverty at gene.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("bigmemoryExtras")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.12)，bigmemory(> = 4.5.31)
进口	方法
链接
建议	testthat，BiocGenerics，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/phaverty/bigmemoryExtras
全靠我
进口我	methyAnalysis
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmemoryExtras
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bigmemoryExtras
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bigmemoryExtras/
软件包下载报告	下载数据