啤酒
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DOI:10.18129 / B9.bioc.beer
贝叶斯浓缩在R估计
Bioconductor版本:版本(3.17)
啤酒实现贝叶斯模型分析phage-immunoprecipitation测序(PhIP-seq)数据。鉴于PhIPData对象,啤酒返回浓缩抗体反应的后验概率,点估计的相对叠化相比,负控制样本,以及更多。此外,啤酒提供了一个方便的实现使用磨边机识别浓缩抗体反应。
作者:陈雅典娜(aut (cre)
,罗布Scharpf (aut) Ingo Ruczinski (aut)
维护人员:雅典娜陈< achen70 jhu.edu >
从内部引用(R,回车引用(“啤酒”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“啤酒”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“啤酒”)
| HTML | R脚本 | 啤酒 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(1年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.2.0),PhIPDatarjags (> = 1.1.1) |
| 进口 | cli,刨边机,BiocParallel、方法、progressr统计,SummarizedExperiment,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat (> = 3.0.0),BiocStyle,codetools covr knitr、rmarkdown dplyr ggplot2、拼写 |
| SystemRequirements | 安装缺口(4.3.0) |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/athchen/beer/ |
| BugReports | https://github.com/athchen/beer/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | beer_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | beer_1.4.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | beer_1.4.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | beer_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beer |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/啤酒 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/beer/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beer/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
