beachmat

doi:10.18129/b9.bioc.beachmat

编译生物导体以处理每种矩阵类型

生物导体版本:版本(3.15)

提供了一个一致的C ++类接口,用于读取数据并将数据写入各种常用矩阵类型。普通矩阵和几个稀疏/密集矩阵类是直接支持的,第三方S4类可以由外部链接支持,而所有其他矩阵则由延迟式块处理来处理。

作者:Aaron Lun [AUT,CRE],HervéPagès[aut],Mike Smith [aut]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“ Beachmat”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ BeachMat”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Beachmat”)

html R脚本 1.开发人员指南
html R脚本 2.从C ++中的R矩阵读取数据(V2)
html R脚本 3.将数据写入r矩阵对象(V2)
html R脚本 4.支持任意矩阵类(V2)
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.12.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(4。5年)
执照 GPL-3
要看
进口 方法,延迟(> = 0.15.14),生物基因,,,,矩阵,,,,RCPP
链接 RCPP
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,rcmdcheck,,,,生物比较,,,,HDF5Array
系统要求 C ++ 11
增强
URL
取决于我
进口我 Batchelor,,,,生物兴奋,,,,液滴,,,,mumosa,,,,评分,,,,斯克兰,,,,砍伐,,,,辛格
建议我 BSSEQ,,,,Glmgampoi,,,,mbkmeans,,,,PCATOOLS,,,,SCCB2
链接到我 生物兴奋,,,,BSSEQ,,,,液滴,,,,Glmgampoi,,,,mbkmeans,,,,PCATOOLS,,,,斯克兰,,,,砍伐,,,,辛格
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 beachmat_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 beachmat_2.12.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) beachmat_2.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/beachmat
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/beachmat/
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