baySeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.baySeq

经验贝叶斯分析的微分表达式模式计数数据

Bioconductor版本:版本(3.15)

这个包确定微分表达式在高通量计算的数据,比如来自下一代测序机器,计算后验估计可能的微分表达式(或更复杂的假设)通过经验贝叶斯方法。

作者:Thomas j . Hardcastle

维护人员:托马斯·Hardcastle < tjh48在cam.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“baySeq”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“baySeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“baySeq”)

PDF R脚本 先进baySeq分析
PDF R脚本 baySeq
PDF 参考手册

细节

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版本 2.30.0
Bioconductor自 BioC 2.5 (r - 2.10)(12.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = tripwire)、方法GenomicRanges,abind、并行
进口 刨边机
链接
建议 BiocStyle,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 clusterSeq,Rcade,segmentSeq,移行细胞癌
进口我 metaseqR2,riboSeqR,srnadiff
建议我 compcodeR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 baySeq_2.30.0.tar.gz
Windows二进制 baySeq_2.30.0.zip
macOS 10.13(高山脉) baySeq_2.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/baySeq
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ baySeq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/baySeq/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网