Batchelor
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doi：10.18129/b9.bioc.batchelor
单细胞批化方法
生物导体版本：版本（3.15）
实现了多种单细胞（RNA测序）数据批处理的方法。这包括基于检测到相互接近的邻居的方法，以及对数表达值的线性回归的几种有效变体。还提供了执行全局重新缩放的功能，以消除批处理之间的深度差异，并执行主成分分析，该分析对跨批处理的细胞数量的差异很强。
作者：Aaron Lun [AUT，CRE]，Laleh Haghverdi [CTB]
维护者：aaron lun
引用（从r内，输入引用（“ batchelor”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ batchelor”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ batchelor”）
| html | R脚本 | 1.纠正批处理效果 |
| html | R脚本 | 2.扩展方法 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.3 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | Singlecellexperiment |
| 进口 | 总结性特征，，，，S4VECTORS，，，，生物基因，，，，RCPP，统计，方法，utils，Igraph，，，，生物脑，，，，生物兴奋，，，，矩阵，，，，延迟，，，，延迟的matrixstats，，，，生物比较，，，，砍伐，，，，残留matrix，，，，scaledmatrix，，，，beachmat |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，斯克兰，，，，评分，，，，Bluster，，，，scrnaseq |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | 奥斯卡。 |
| 进口我 | 染色体，，，，mumosa，，，，Singlecelltk |
| 建议我 | TSCAN |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | batchelor_1.12.3.3.tar.gz |
| Windows二进制 | batchelor_1.12.3.3.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | batchelor_1.12.3.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/batchelor |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：套餐/batchelor |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/batchelor/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.15的旧源软件包 | 来源存档 |
