barcodetrackR

DOI:10.18129 / B9.bioc.barcodetrackR

分析细胞条码数据的功能

Bioconductor版本:版本(3.15)

barcodetrackR R包开发克隆跟踪数据的分析和可视化。数据所需的样品和标签丰度矩阵形式。通常从细胞条码技术实验、集成网站检索分析,或类似的技术。

作者:迭戈亚历山大•埃斯皮诺萨(aut (cre)阮兰德马忒拉克(aut)

维护人员:迭戈亚历山大·埃斯皮诺萨< diego.espinoza pennmedicine.upenn.edu >

从内部引用(R,回车引用(“barcodetrackR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“barcodetrackR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“barcodetrackR”)

HTML R脚本 barcodetrackR
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文本 新闻
文本 许可证

细节

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版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证 文件许可证
取决于 R (> = 4.1)
进口 cowplot,circlize,dplyr,ggplot2,ggdendro,ggridges、图形、grDevicesmagrittr,plyr,代理,RColorBrewer,rlang,尺度,闪亮的统计数据,SummarizedExperiment,S4Vectors,宠物猫,tidyr,素食主义者,冬青,跑龙套
链接
建议 BiocStyle,knitr,魔法,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/dunbarlabNIH/barcodetrackR
取决于我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 barcodetrackR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 barcodetrackR_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉) barcodetrackR_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/barcodetrackR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ barcodetrackR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/barcodetrackR/
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