bandle

DOI:10.18129 / B9.bioc.bandle

R包贝叶斯分析的微分亚细胞定位实验

Bioconductor版本:版本(3.15)

Bandle包使微分本地化实验的分析和可视化质谱仪使用数据。实验方法支持包括动态LOPIT-DC hyperLOPIT、动态Organellar地图、动态卡式肺囊虫肺炎。它提供了Bioconductor基础设施来分析这些数据。

作者:奥利弗·m·克鲁克(aut (cre)丽莎Breckels (aut)

维修工:奥利弗·m·克鲁克<奥利弗。骗子在stats.ox.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bandle”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“bandle”)

HTML	R脚本	分析微分本地化实验BANDLE:小插图1
HTML	R脚本	分析差动本地化与BANDLE实验:小插图2
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1),S4Vectors,Biobase,MSnbase,pRoloc
进口	Rcpp(> = 1.0.4.6),pRolocdata,lbfgs,ggplot2,dplyr,plyr,knitr、方法、BiocParallel,robustbase,BiocStyle,ggalluvial,ggrepel,tidyr,circlizegrDevices、图形、数据、跑龙套,rlang
链接	Rcpp,RcppArmadillo,黑洞
建议	coda(> = 0.19 - 4),testthat,插值函数,字段,pheatmap,冬青,rmarkdown,拼写
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/ococrook/bandle
BugReports	https://github.com/ococrook/bandle/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bandle_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	bandle_1.0.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉)	bandle_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bandle
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bandle
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bandle/
包下载报告	下载数据