舞会礼服

DOI:10.18129 / B9.bioc.ballgown

灵活,isoform-level微分表达式分析

Bioconductor版本:版本(3.13)

组装转录组的统计分析工具,包括灵活的微分表达式分析、文本结构的可视化,匹配组装记录注释。

作者:杰克傅(aut) Alyssa c Frazee (aut (cre),莱昂纳多Collado-Torres (aut),杰弗里·t·安德鲁·e·贾菲(aut)韭菜(aut,黑色)

维护人员:杰克傅< jmfu jhsph.edu >

从内部引用(R,回车引用(“舞会礼服”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“舞会礼服”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

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browseVignettes(“舞会礼服”)

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细节

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版本 2.24.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 3.1.1)方法
进口 GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.9.39),RColorBrewer样条函数,股东价值分析,limma,rtracklayer(> = 1.29.25),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb
链接
建议 testthat,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
取决于我 VaSP
进口我 RNASeqR
建议我 聚酯,variancePartition
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ballgown_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 ballgown_2.24.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ballgown_2.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/舞会礼服
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/
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