自治

DOI:10.18129 / B9.bioc.autonomics

泛型和intuifying跨平台的组学分析

Bioconductor版本:版本(3.15)

这个包提供了一个通用的跨平台的组学数据分析和直观的解决方案。导入功能,预处理、勘探、对比分析和组学数据的可视化。它遵循一个整洁,函数式编程范例。

作者:Aditya Bhagwat (aut (cre) Shahina哈亚特(aut)是安娜Halama[所有],理查德棉花(施)、罗兰Cougnaud[所有],鲁道夫Engelke(施)-辛里奇Goehlmann[难过],卡斯滕Suhre[难过],Johannes Graumann (aut,悲伤,仅仅)

维护人员:Aditya Bhagwat < Aditya。在mpi-bn.mpg.de bhagwat >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“自治”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“自治”)

HTML	R脚本	using_autonomics
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	abind,自信的,BiocFileCache,BiocGenerics,色彩,data.table,刨边机,ggplot2,ggrepel、图形grDevices、网格gridExtra,limma,magrittr,matrixStats、方法、MultiAssayExperiment平行,pcaMethods,rappdirs,rlang,R.utils,readxl,S4Vectors,尺度统计数据,stringi,SummarizedExperiment,tidyr、工具、跑龙套
链接
建议	affy,AnnotationDbi,BiocManager,图,GenomicRanges,GEOquery,hgu95av2.db,ICSNP,knitr,lme4,lmerTest,质量,mixOmics,mpm,nlme,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,RCurl,遥控器,rmarkdown,ropls,Rsubread,rtracklayer,seqinr,statmod,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/bhagwataditya/autonomics
BugReports	https://bitbucket.org/graumannlabtools/autonomics
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	autonomics_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	autonomics_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	autonomics_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/autonomics
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/自治
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/autonomics/
包下载报告	下载数据