吸引

doi:10.18129/b9.bioc.Attract

找到代表Kauffman吸引子景观驱动因素的基因表达模块的方法

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包包含函数,以找到代表Kauffman吸引者景观驱动因素的基因表达模块。这些模块是区分不同感兴趣群体类型的核心吸引子途径。每个途径都有一组Synexpression组,它们显示基因表达的转录协调变化。

作者:杰西卡·玛(Jessica Mar)

维护人员:samuel Zimmerman

引用(从r内,输入引用(“吸引”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“吸引”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“吸引”)

PDF R脚本 有关如何在\ texttt {lavep}软件包中使用函数的教程
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细节

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版本 1.48.0
在生物导体中 Bioc 2.7(R-2.12)(12年)
执照 LGPL(> = 2.0)
要看 r(> = 3.4.0),AnnotationDbi
进口 生物酶,,,,林玛,,,,,,,,gostats,图形,统计信息,Reactome.db,,,,keggrest,,,,org.hs.eg.db,utils,方法
链接
建议 Illuminahumanv1.db
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 apping_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 lacte_1.48.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) laws_1.48.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/attract
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/吸引
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/attract/
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