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arrayQualityMetrics
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DOI:10.18129 / B9.bioc.arrayQualityMetrics
微阵列数据集的质量度量报告
Bioconductor版本:发行版(3.15)
这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。支持一种和两种颜色阵列平台。
作者:奥黛丽·考夫曼，沃尔夫冈·胡贝尔
维修员:迈克·史密斯<迈克。史密斯在embl.de>
引用(从R中，输入引用(“arrayQualityMetrics”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("arrayQualityMetrics")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)
| R脚本 | 高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理 | |
| R脚本 | 简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 3.52.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 2.1 (R-2.6)(15年) |
| 许可证 | LGPL (>= 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | affy，affyPLM(> = 1.27.3),beadarray，Biobase，genefilter、图形、grDevices、网格、gridSVG(> = 1.4 3),Hmisc，hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、RColorBrewer，setRNG， stats, utils，vsn(> = 3.23.3),XML，svglite |
| 链接 | |
| 建议 | ALLMLL，亚兰，BiocStyle，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/grimbough/arrayQualityMetrics/issues |
| 全靠我 | maEndToEnd |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | arrayQualityMetrics_3.52.0.tar.gz |
| Windows二进制 | arrayQualityMetrics_3.52.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | arrayQualityMetrics_3.52.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/arrayQualityMetrics |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
