alevinQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.alevinQC

为Alevin输出生成QC报告

Bioconductor版本:发行版(3.16)

生成总结alevin运行输出的QC报告。报表可以以html或pdf文件的形式生成,也可以以闪亮的应用程序的形式生成。

作者:Charlotte Soneson [aut, cre],阿维·斯里瓦斯塔瓦[aut],罗伯·帕特罗[aut],何东泽[aut]

维护者:Charlotte Soneson

引文(从R内,输入引用(“alevinQC”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“alevinQC”)

超文本标记语言 R脚本 alevinQC
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

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版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 4.0)
进口 rmarkdown(>= 2.5),工具,方法,ggplot2GGallydplyrrjson闪亮的shinydashboardDT,统计,utils,tximport(> = 1.17.4),cowplotrlangRcpp
链接 Rcpp
建议 knitrBiocStyletestthat(> = 3.0.0),BiocManager
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL https://github.com/csoneson/alevinQC
BugReports https://github.com/csoneson/alevinQC/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 alevinQC_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 alevinQC_1.14.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) alevinQC_1.14.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) alevinQC_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinQC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alevinQC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/alevinQC/
软件包下载报告 下载数据

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网