加合体

doi:10.18129/b9.bioc.adductomicsr

加成质谱数据集的处理

生物导体版本:版本(3.15)

过程MS2数据以鉴定从光谱中的潜在加入的肽,这些肽已被校正了质量漂移和保留时间漂移,并量化了MS1水平质谱峰。

作者:josie hayes

维护者:josie hayes

引用(从r内,输入引用(“加度”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ AdductomicSr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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browsevignettes(“加度”)

html R脚本 加成学工作流程
PDF 参考手册

细节

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版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6),加合物,,,,实验室,,,,AnnotationHub
进口 并行(> = 3.3.2),Data.Table(> = 1.10.4),orgmassspecr(> = 0.4.6),foreach(> = 1.4.3),MZR(> = 2.14.0),ADE4(> = 1.7.6),rvest(> = 0.3.2),过去(> = 1.3.18),RESHAPE2(> = 1.4.2),pracma(> = 2.0.4),DT(> = 0.2),FPC(> = 2.1.10),Dosnow(> = 1.0.14),快速积分(> = 1.1.22),rcppeigen(> = 0.3.3.3.0),引导程序(> = 2017.2),更光滑(> = 1.1),dplyr(> = 0.7.5),动物园(> = 1.8),stats(> = 3.5.0),utils(> = 3.5.0),graphics(> = 3.5.0),grdevices(> = 3.5.0),方法(> = 3.5.0),数据集(> = 3.5.0)
链接
建议 尼特(> = 1.15.1),rmarkDown(> = 1.5),rdisop(> = 1.34.0),测试
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/josielhayes/adductomicsr/issues
取决于我
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源包 Adructomicsr_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 ructuctomicsr_1.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) ructuctomicsr_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adductomicsr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/辅助组织
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/adductomicsr/
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