- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- XINA
XINA
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.XINA
为网络分析的多放映场影剧院等压质量Tagged-based动力学数据
Bioconductor版本:版本(3.16)
XINA的目的是,以确定哪些蛋白质中表现出相似的模式,在实验条件下,由于蛋白质与co-abundance模式可能有共同的分子功能。XINA进口多个数据集,网上标签数据集,结合后续子群的数据到多个集群。结果是一个输出描述变化在所有条件。XINA,不仅提取coabundance概要文件内和在实验中,还包含了数据库和蛋白质间交互作用等综合资源KEGG来推断扶少团团员和分子功能,分别产生直观的图形输出。
作者:朗Ho李< lhlee bwh.harvard.edu >和萨沙a·辛格< sasingh bwh.harvard.edu >
维护者:朗Ho李< lhlee bwh.harvard.edu >和萨沙a·辛格< sasingh bwh.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“XINA”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“XINA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“XINA”)
| HTML | R脚本 | xina_user_code |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(4年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | mclust,plyr,冲积,ggplot2,igraph,gridExtra、工具、grDevices图形,跑龙套,STRINGdb |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | XINA_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | XINA_1.16.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | XINA_1.16.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | XINA_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XINA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ XINA |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/XINA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/XINA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
