vplotr
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doi：10.18129/b9.bioc.vplotr
制作V图和计算足迹配置文件的一组工具
生物导体版本：版本（3.13）
消化和保护DNA核酸酶的模式，例如DNase I，微球菌核酸酶和TN5转座酶可用于推断相关蛋白的位置。该软件包包含有用的功能来分析配对末端测序片段密度的模式。VPLOTR促进了对单个或聚集的基因组基因座的V-图和足迹轮廓的产生。
作者：Jacques Serizay [AUT，CRE]
维护者：jacques serizay
引用（从r内，输入引用（“ vplotr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ vplotr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ vplotr”）
| html | R脚本 | vplotr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 4.0），基因组机，，，，iranges，，，，GGPLOT2 |
| 进口 | 牛仔图，，，，马格里特，，，，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，rcolorbrewer，，，，动物园，，，，rsamtools，，，，S4VECTORS， 平行，RESHAPE2，方法，图形，统计 |
| 链接 | |
| 建议 | GenomicFeatures，，，，txdb.scerevisiae.ucsc.saccer3.sgdgene，，，，测试，，，，COVR，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，pkgdown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/js2264/vplotr |
| BugReports | https://github.com/js2264/vplotr/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | vplotr_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | vplotr_1.2.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | vplotr_1.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vplotr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/vplotr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/vplotr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |
