生物导体版本:版本(3.15)
ULARCIRC在星形对齐的剪接连接文件中读取,并提供可视化和分析工具用于剪接分析。用户可以评估后置路口和前进典型连接。
作者:David Humphreys [AUT,CRE]
维护者:David Humphreys
引用(从r内,输入引用(“ ularcirc”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ ularcirc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ularcirc”)
html | R脚本 | Ularcirc |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(3.5岁) |
执照 | 文件执照 |
要看 | R(> = 3.4.0) |
进口 | AnnotationHub,,,,AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,Data.Table(> = 1.9.4),DT,,,,GenomicFeatures,,,,GenomeInfodB,,,,GenomeInfodBdata,,,,基因组签名,,,,基因组机,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,gsubfn,,,,mirbase.db,,,,时刻,,,,有机体,,,,Plotgardener,,,,r.utils,,,,S4VECTORS,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,光泽,,,,Shinyjs,,,,Yaml |
链接 | |
建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,生物使用,,,,httpuv,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,rmarkDown,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ularcirc_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | ularcirc_1.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | ularcirc_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ularcirc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ularcirc |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ularcirc/ |
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