Titancna
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.titancna
从肿瘤的整个基因组测序中的亚克隆拷贝数和LOH预测
生物导体版本：版本（3.15）
隐藏的马尔可夫模型以细分和预测亚克隆拷贝数改变（CNA）的区域和杂合性丧失（LOH），并估计肿瘤整个基因组测序数据中克隆簇的细胞患病率。
作者：加文
维护者：fredhutch.org的Gavin ha
引用（从r内，输入引用（“ titancna”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ titancna”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ titancna”）
| R脚本 | titancna.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.34.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（8年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.5.1） |
| 进口 | 生物基因（> = 0.31.6），iranges（> = 2.6.1），基因组机（> = 1.24.3），变体（> = 1.18.7），foreach（> = 1.4.3），GenomeInfodB（> = 1.8.7），Data.Table（> = 1.10.4），dplyr（> = 0.5.0） |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/gavinha/titancna |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | titancna_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | titancna_1.34.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | titancna_1.34.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/titancna |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/titancna |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/titancna/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
