Bioconductor版本:版本(3.13)
实现了一个DelayedArray端读写稠密或稀疏阵列的TileDB格式。结果TileDBArrays兼容所有可以接受DelayedArray Bioconductor管道实例。
作者:亚伦Lun (aut (cre),基因泰克公司(cph)
维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“TileDBArray”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TileDBArray”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TileDBArray”)
HTML | R脚本 | 用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.2.1 " |
Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(0.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | DelayedArray(> = 0.15.16) |
进口 | 方法,Rcpp,tiledb,S4Vectors |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,矩阵,rmarkdown,BiocStyle,BiocParallel,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/LTLA/TileDBArray |
BugReports | https://github.com/LTLA/TileDBArray |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | TileDBArray_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | TileDBArray_1.2.1.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | TileDBArray_1.2.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TileDBArray |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TileDBArray |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TileDBArray/ |
包下载报告 | 下载数据 |
老BioC 3.13源码包 | 源存档 |