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TMixClust
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TMixClust
时间序列聚类的基因表达与高斯Mixed-Effects模型和平滑样条函数
Bioconductor版本:版本(3.16)
实现时间序列基因表达数据的聚类方法基于mixed-effects模型和高斯变量和非参数三次样条函数估计。该方法可以强劲占高水平的噪音在典型的基因表达时间序列数据集。
作者:莫妮卡Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >
维护人员:莫尼卡Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“TMixClust”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TMixClust”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TMixClust”)
| R脚本 | 与TMixClust聚类时间序列基因表达数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | gss,mvtnorm统计数据,动物园,集群跑龙套,BiocParallel,flexclustgrDevices图形,Biobase,SPEM |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown,knitr,BiocStyle,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TMixClust_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TMixClust_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | TMixClust_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | TMixClust_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TMixClust |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TMixClust/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TMixClust/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
