TFHAZ
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doi：10.18129/b9.bioc.tfhaz
转录因子高积累区
生物导体版本：版本（3.15）
它发现trascription因子（TF）高积累DNA区，即沿着基因组的区域，在那里存在不同的转录因子。从包含TF结合区域基因组位置的数据集开始，对于所选染色体的每个碱基，计算TFS的积累。可以使用三种不同类型的积累（TF，区域和基础积累），以及在单个基础积累计算中考虑的可能性，不仅在该单个基础中，而且在其附近，在其附近，在其附近，在其窗口中存在给定的宽度。可以使用两种不同的方法来搜索TF高积累DNA区，称为“结合区域”和“重叠”。另外，提供了一些功能，以分析，可视化和比较使用不同的输入参数获得的结果。
作者：Marco Masseroli的Alberto Marchesi
维护者：gmail.com上的Alberto Marchesi
引用（从r内，输入引用（“ TFHAZ”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ TFHAZ”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ TFHAZ”）
| html | R脚本 | TFHAZ |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 基因组机，，，，S4VECTORS，grdevices，图形，统计，utils，iranges， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
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| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tfhaz_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tfhaz_1.18.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | tfhaz_1.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tfhaz |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/tfhaz |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tfhaz/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
