tcgautils
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doi：10.18129/b9.bioc.tcgautils
TCGA实用程序用于数据管理
生物导体版本：版本（3.13）
一套用于检查和操纵TCGA数据的辅助函数，包括从策展tcgadata实验软件包中获得的数据。这些功能旨在简化并使使用TCGA数据更易于管理。
作者：Marcel Ramos [AUT，CRE]，Lucas Schiffer [AUT]，Sean Davis [CTB]，Levi Waldron [AUT]
维护者：Marcel Ramos
引用（从r内，输入引用（“ Tcgautils”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tcgautils”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Tcgautils”）
| html | R脚本 | Tcgautils Essentials |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 4.0.0） |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，生物基因，，，，GenomeInfodB，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，GenomicDataCommons，，，，iranges， 方法，多亚sayExexperiment，，，，破烂的经历（> = 1.5.7），rvest，，，，S4VECTORS，统计Stringr，，，，总结性特征，utils，XML2 |
| 链接 | |
| 建议 | Biocfilecache，，，，生物使用，，，，策展，，，，复杂的图像，，，，DevTools，，，，dplyr，，，，Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，，，，算，，，，尼特，，，，马格里特，，，，mirbase.db，，，，org.hs.eg.db，，，，rcolorbrewer，，，，readr，，，，rmarkDown，，，，rtcgatoolbox（> = 2.17.4），rtracklayer，，，，r.utils，，，，测试，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/tcgautils/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | cbioportaldata，，，，rtcgatoolbox |
| 建议我 | cnvranger，，，，策展，，，，DCE，，，，Glmsparsenet，，，，netdx |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tcgautils_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tcgautils_1.12.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | tcgautils_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcgautils |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/tcgautils |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tcgautils/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
