SynMut

DOI:10.18129 / B9.bioc.SynMut

SynMut:设计同义突变序列具有不同基因签名

Bioconductor版本:版本(3.13)

越来越多的要求设计病毒突变体与特定的二核苷酸或密码子组成。这个工具可以把二核苷酸偏好和/或密码子使用偏见突变体设计时考虑。它是一个功能强大的工具,在计算机设计的DNA序列突变体。

作者:Haogao Gu (aut (cre),狮子座L.M. Poon(领导)

维修工:Haogao顾< hggu在connect.hku.hk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SynMut”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SynMut”)

HTML	R脚本	SynMut:设计同义突变的DNA序列
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	seqinr、方法、Biostrings,stringr,BiocGenerics
链接
建议	BiocManager,knitr,rmarkdown,testthat,devtools,prettydoc,胶水
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Koohoko/SynMut
BugReports	https://github.com/Koohoko/SynMut/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SynMut_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	SynMut_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	SynMut_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynMut
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynMut
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SynMut/
包下载报告	下载数据