摘要博马克

DOI：10.18129 / b9.bioc.summarizedbenchmark.

用于执行基准比较的类和方法

Biocometiond版本：释放（3.12）

此程序包定义用于构建，执行和评估计算方法的基准实验的基准测试和摘要阶段。SummarizedBenchmark类扩展了范围的ummarizedExperiment对象，旨在提供基础架构来存储和比较将不同方法应用于共享数据集的结果。此类提供了一个集成接口，可以存储元数据，例如方法参数和软件版本以及地面真理（当可用时）和评估度量。

作者：Alejandro Reyes [Aut]，Patrick Kimes [Aut，CRE]

维护者：Patrick Kimes

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！procenameSpace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager :: install（“汇总禁止”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	2.8.0
在生物导体中以来	BIOC 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL（> = 3）
依靠	r（> = 3.6），Tidyr.那概括分析那S4Vectors.那生物根系， 方法，沮丧那rlang.那stringr.，实用，生物相投那ggplot2.那蒙链那dplyr.那消化那sessioninfo.那蜡笔那娇媚
进口
链接到
建议	Icobra.那生物焦那kn那Magrittr.那IHW.那QValue.那testthat.那deseq2.那edger.那林马那tximport.那读书那scrnapeq.那泼溅那撒尿那rnaseqcomp.那生物雕
系统要求
加强
URL.	https://github.com/areyesq89/summarizedbenchmark.http://biocidodder.org/packages/summarizedBenchmark/
Bugreports.	https://github.com/areyesq89/summarizedbenchmark/issues.
取决于我
进口我
建议我	BenchmarkFdrdata2019
链接给我
建立报告

包档案包

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源包	summarizedbenchmark_2.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件	SummarizedBenchmark_2.8.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	equalarizedbenchmark_2.8.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/summarizedBenchmark.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/摘要
包短网址	https://biocumon.org/packages/summarizedbenchmark/
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