彩带

DOI:10.18129 / B9.bioc.Streamer

启用大文件的流处理

Bioconductor版本:Release (3.15)

在R中处理大数据文件可能很困难,因为R中的数据通常驻留在内存中。这个包鼓励一种编程风格,即数据通过“生产者”和一系列“消费者”从磁盘“流”到R,通常将原始数据减少到可管理的大小。该包为数据输入、采样、索引和转换等操作提供了有用的生产者和消费者流组件;看到包吗?彩带for details.

作者:Martin Morgan, Nishant Gopalakrishnan

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

引文(从R内,输入引用(“流光”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“流光”)

PDF R脚本 Streamer:一个简单的例子
PDF 参考手册

细节

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版本 1.42.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(10.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 方法,RBGL平行,BiocGenerics
链接
建议 RUnitRsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignmentsRgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 plethy
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Streamer_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 Streamer_1.42.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) Streamer_1.42.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Streamer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Streamer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Streamer/
软件包下载报告 下载数据

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网