剪接图
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doi：10.18129/b9.bioc.splicinggraphs
创建，操纵，可视化剪接图并分配RNA-Seq读取给它们
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包允许用户根据给定生物体的基因模型创建，操纵和可视化剪接图及其气泡。此外，它允许用户将RNA-Seq读取为一组剪接图的边缘，并以不同的方式进行汇总。
作者：D。Bindreither，M。Carlson，M。Morgan，H。Pagès
维护者：h.pagès
引用（从r内，输入引用（“剪接图”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ SplicingGraphs”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“剪接图”）
| R脚本 | 剪接图和RNA-seq数据 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（9。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | GenomicFeatures（> = 1.17.13），基因组签名（> = 1.1.22），rgraphviz（> = 2.3.7） |
| 进口 | 方法，utils，图形，Igraph，，，，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.17.5），生物比较，，，，iranges（> = 2.21.2），GenomeInfodB，，，，基因组机（> = 1.23.21），GenomicFeatures，，，，rsamtools，，，，基因组签名，，，，图形，，，，rgraphviz |
| 链接 | |
| 建议 | Igraph，，，，GVIZ，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/splicinggraphs |
| BugReports | https://github.com/bioconductor/splicinggraphs/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | SplicingGraphs_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SplicingGraphs_1.36.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | SplicingGraphs_1.36.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splicinggraphs |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/剪接图 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/splicinggraphs/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
