- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- SplicingFactory
SplicingFactory
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SplicingFactory
剪接转录组数据的多样性分析
Bioconductor版本:版本(3.17)
SplicingFactory R包使用转录水平的表达值根据各种统计分析剪接多样性措施,如香农熵或基尼指数。这些措施可以量化记录同种型多样性之间的样品或条件。此外,该方案分析了同种型多样性数据,寻找条件之间的显著变化。
作者:彼得·a . Szikora (aut),答摩(aut), Endre塞巴斯蒂(aut (cre)
维护人员:Endre塞巴斯蒂< Endre。塞巴斯蒂安在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“SplicingFactory”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SplicingFactory”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SplicingFactory”)
| HTML | R脚本 | SplicingFactory |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | SummarizedExperiment、方法、统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat、knitr rmarkdown、ggplot2 tidyr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/esebesty/SplicingFactory |
| BugReports | https://github.com/esebesty/SplicingFactory/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SplicingFactory_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SplicingFactory_1.8.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SplicingFactory_1.8.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SplicingFactory_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SplicingFactory |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SplicingFactory |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SplicingFactory/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SplicingFactory/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
