蜘蛛网
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doi：10.18129/b9.bioc.spidermir
蜘蛛网：用于综合网络分析的R/生物通用套件与miRNA数据
生物导体版本：版本（3.15）
Spidermir的目的是：i）促进网络从GeneMania数据中从GeneMania数据中检索网络，ii）使用适当的基因命名法制备数据，iii）在特定网络中将miRNA数据整合到特定网络中，iv）提供不同的标准分析和V）允许用户可视化结果。更详细地，该软件包提供了多种查询，准备和下载网络数据（GeneMania）的方法，并与经过验证和预测的miRNA数据（Mirwalk，Mirtarbase，Mirandola，Mirandola，Miranda，Miranda，Pictar和TargetScan）集成。此外，我们还提出了一项统计检验，以使用DGIDB和Matador数据库得出的基因 - 药物相互作用来识别药物-MIR的关系。
作者：Claudia Cava，Antonio Colaprico，Alex Graudenzi，Gloria Bertoli，Tiago C. C. C. Silva，Catharina Olsen，Houtan Noushmehr，Gianluca Bontempi，Giancarlo Mauri，Isabella Castiglioniiii castiglioniii
维护者：claudia cava
引用（从r内，输入引用（“蜘蛛网”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ spidermir”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（6年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | R（> = 3.0.0） |
| 进口 | httr，，，，Igraph，utils，统计，mirnatap，，，，mirnatap.db，，，，AnnotationDbi，，，，org.hs.eg.db，，，，GGPLOT2，，，，栅格，，，，GPLOTS，grdevices，格子，，，，LatticeExtra，，，，tcgabiolinks，，，，gdata，，，，Mageckflute |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，DevTools，，，，roxygen2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/claudiacava/spidermir |
| BugReports | https://github.com/claudiacava/spidermir/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Starbiotrek |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | spidermir_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | spidermir_1.26.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spidermir |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/蜘蛛网 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/spidermir/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
