光谱

DOI:10.18129 / B9.bioc.Spectra

光谱质谱数据的基础设施

Bioconductor版本:版本(3.13)

光谱包定义了一个有效的基础设施来存储和处理质谱光谱和功能子集,过程,可视化和比较光谱数据。它提供了不同的实现(后端)来存储质谱数据。这些包括后端调整了快速数据访问和处理和后端到非常大的数据集确保一个小内存占用。

作者:RforMassSpectrometry包维护者(cre)。劳伦与(aut),Johannes Rainer (aut)Sebastian吉布(aut)

维修工:RforMassSpectrometry包维护者<维护者rformassspectrometry.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“光谱”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(“光谱”)

HTML	R脚本	描述和光谱的使用对象
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0.0),S4Vectors,BiocParallel,ProtGenerics(> = 1.23.8)
进口	方法,IRanges,MsCoreUtils(> = 1.3.3)、图形、grDevices统计,工具,跑龙套,fs,BiocGenerics
链接
建议	testthat,knitr(> = 1.1.0),msdata(> = 0.19.3),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),mzR(> = 2.19.6),rhdf5(> = 2.32.0),rmarkdown,vdiffr,magrittr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/Spectra
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/Spectra/issues
取决于我	MsBackendMassbank,MsBackendMgf
进口我
建议我	xcms
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Spectra_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	Spectra_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Spectra_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Spectra
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/光谱
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Spectra/
包下载报告	下载数据