SpeCond

DOI:10.18129 / B9.bioc.SpeCond

条件表达式的具体检测数据

Bioconductor版本:版本(3.16)

这个包执行基因表达数据分析来检测condition-specific基因。这样明显上升或下调基因在一个小数量的条件。它是通过拟合的混合正态分布表达式的值。条件可以是环境条件,不同组织、器官或任何其他来源,你想比较基因表达。

作者:佛罗伦萨卡瓦利

维护人员:佛罗伦萨卡瓦利<佛罗伦萨在ebi.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“SpeCond”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SpeCond”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SpeCond”)

PDF R脚本 SpeCond
PDF 参考手册

细节

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版本 1.52.0
Bioconductor自 BioC 2.5 (r - 2.10)(13岁)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.10.0),mclust(> = 3.3.1),Biobase(> = 1.15.13),字段,hwriter(> = 1.1),RColorBrewer、方法
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SpeCond_1.52.0.tar.gz
Windows二进制 SpeCond_1.52.0.zip
macOS二进制(x86_64) SpeCond_1.52.0.tgz
macOS二进制(arm64) SpeCond_1.52.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpeCond
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SpeCond
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SpeCond/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SpeCond/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网