Spatiaxlexperiment
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doi：10.18129/b9.bioc.bioc.spatiaxlexperiment
S4类用于空间解析的转录组学数据
生物导体版本：版本（3.15）
定义一个用于从空间分辨转录组学（ST）实验中存储数据的S4类。该类扩展了单链球运动，以支持基于点和基于分子的ST平台的存储和检索其他信息，包括空间坐标，图像和图像元数据。包括10倍基因组学visium平台数据的专门构造函数。
作者：Dario Righelli [AUT，CRE]，Davide Risso [AUT]，Helena L. Crowell [AUT]，Lukas M. Weber [AUT]
维护者：dario righelli
引用（从r内，输入引用（“ Spatiaxlexperiment”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Spatialexperiment”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Spatiaxlexperiment”）
| html | R脚本 | 《时空感染课程》简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（2年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | 方法，Singlecellexperiment |
| 进口 | rjson，grdevices，魔术，utils，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，液滴，，，，生物基因，，，，Biocfilecache |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物使用，，，，bumpymatrix |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/drighelli/spatialexperiment |
| BugReports | https://github.com/drighelli/spatialexperiment/issues |
| 取决于我 | 实验值，，，，Imcrtools，，，，MousegastrulationData，，，，空间Libd，，，，Stexampledata，，，，tenxvisiumdata，，，，vectrapolarisdata |
| 进口我 | ggspavis，，，，nnsvg，，，，Singlecellmultimodal，，，，Spatialde，，，，待机 |
| 建议我 | Geomxtools，，，，聚光灯 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Spatiaxlexperiment_1.6.1.tar.gz |
| Windows二进制 | spatiaxlexperiment_1.6.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Spatialexperiment_1.6.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialexperiment |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/spatiaxlexperiment |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/spatialexperiment/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.15的旧源软件包 | 来源存档 |
