辛格
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doi：10.18129/b9.bioc.singler
基于参考的单细胞RNA-seq注释
生物导体版本：版本（3.13）
通过利用纯细胞类型的参考转录组数据集来独立推断每个单个单元的原点细胞，从而从单细胞RNA测序数据中执行无偏的细胞类型识别。
作者：Dvir Aran [AUT，CPH]，Aaron Lun [CTB，CRE]，Daniel Bunis [CTB]，Jared Andrews [CTB]，FriederikeDündar[CTB]
维护者：aaron lun
引用（从r内，输入引用（“ Singler”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ singler”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Singler”）
| html | R脚本 | 注释SCRNA-SEQ数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.10（R-3.6）（1。5年） |
| 执照 | GPL-3 +文件执照 |
| 要看 | 总结性特征 |
| 进口 | 方法，矩阵，，，，S4VECTORS，，，，延迟，，，，延迟的matrixstats，，，，生物脑，，，，生物比较，，，，生物兴奋，统计，utils，RCPP，，，，beachmat， 平行 |
| 链接 | RCPP，，，，beachmat |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，生物基因，，，，Singlecellexperiment，，，，砍伐，，，，评分，，，，斯克兰，，，，scrnaseq，，，，GGPLOT2，，，，pheatmap，grdevices，栅格，，，，维里迪斯，，，，CellDex |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ltla/singler |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/ |
| 取决于我 | 奥斯卡。 |
| 进口我 | Singlecelltk |
| 建议我 | tidysinglecellexperiment |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Singler_1.6.1.tar.gz |
| Windows二进制 | singler_1.6.1.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | Singler_1.6.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singler |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/新人 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/singler/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |
