SingleCellExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.SingleCellExperiment

单单元格数据的S4类

生物导体版本:发布(3.13)

定义一个S4类用于存储来自单细胞实验的数据。这包括存储和检索峰值信息的专门方法、每个细胞的降维坐标和大小因子，以及基因和库的通常元数据。

作者:Aaron Lun [aut, cph]， Davide Risso [aut, cre, cph]， Keegan Korthauer [ctb]， Kevin Rue-Albrecht [ctb]

维护者:Davide Risso < Risso。大卫。gmail.com >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SingleCellExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	1.singlecellexper实验课的介绍
超文本标记语言	R脚本	2.应用在一个singlecellexperexperiment对象上
超文本标记语言	R脚本	3.围绕singlecellexexperiment类进行开发
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.14.1
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	SummarizedExperiment
进口	方法,跑龙套,统计数据,S4Vectors，BiocGenerics，GenomicRanges，DelayedArray
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，矩阵，scRNAseq，Rtsne
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	基础知识，后面;，BayesSpace，催化剂，CellBench，CelliD，CellTrails，印度豹，clusterExperiment，cydar，cytomapper，DropletUtils，ExperimentSubset，HCAData，imcdatasets，iSEE，LoomExperiment，桅杆，米娅，MouseGastrulationData，MouseThymusAgeing，mumosa，muscData，POWSC，scAlign，嘘，scClassifR，scDataviz，scGPS，schex，scPipe，食物，scRNAseq，天窗，singleCellTK，SpatialExperiment，飞溅，switchde，TENxBrainData，TENxPBMCData，tidySingleCellExperiment，TMExplorer，TrajectoryUtils，TreeSummarizedExperiment，三轮车，TSCAN，zinbwave
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我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SingleCellExperiment_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	SingleCellExperiment_1.14.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SingleCellExperiment_1.14.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SingleCellExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SingleCellExperiment/
包下载报告	下载数据
BioC 3.13的旧源包	源存档