Bioconductor版本:发行版(3.16)
SimBindProfiles识别基因组平铺阵列数据中常见和唯一的结合区域。这个包不依赖于峰值调用,而是直接比较在同一数组平台上处理的绑定概要文件。它实现了一个简单的阈值方法,从而允许检索数据集之间的共同和差异绑定区域,以及补偿和增加绑定的事件。
作者:贝蒂娜·费舍尔,恩里科·费雷罗,罗伯特·斯托尼克,史蒂夫·拉塞尔
维护者:Bettina Fischer
引文(从R内,输入引用(“SimBindProfiles”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SimBindProfiles”)
R脚本 | SimBindProfiles:相似的绑定配置文件,识别阵列基因组平铺阵列数据中常见和唯一的区域 | |
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.36.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(9.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 2.10),方法,林格 |
进口 | limma,mclust,Biobase |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SimBindProfiles_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | SimBindProfiles_1.36.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | SimBindProfiles_1.36.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | SimBindProfiles_1.36.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimBindProfiles |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SimBindProfiles |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SimBindProfiles/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SimBindProfiles/ |
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