Seqvartools

doi:10.18129/b9.bioc.seqvartools

变体数据的工具

生物导体版本:版本(3.15)

SEQARRAY中提供的VCF数据的快速访问存储格式的接口,并提供用于常见操作和分析的工具。

作者:斯蒂芬妮·戈加滕(Stephanie M. Gogarten),Xiuwen Zheng,Adrienne Stilp

维护者:Stephanie M. Gogarten

引用(从r内,输入引用(“ Seqvartools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Seqvartools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Seqvartools”)

PDF R脚本 Seqvartools简介
PDF R脚本 Seqvartools中的迭代器
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.34.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(9年)
执照 GPL-3
要看 Seqarray
进口 grdevices,图形,统计,方法,生物酶,,,,生物基因,,,,GDSFMT,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,gwasexacthw,,,,logistf,,,,矩阵,,,,Data.Table
链接
建议 生物使用,,,,运行,,,,Stringr
系统要求
增强
URL https://github.com/smgogarten/seqvartools
取决于我
进口我 创世纪,,,,variantexperiment
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqvartools_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 seqvartools_1.34.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) seqvartools_1.34.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqvartools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqvartools
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/seqvartools/
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