Seqgate
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doi：10.18129/b9.bioc.seqgate
过滤低表达的功能
生物导体版本：版本（3.15）
在进行统计分析之前，过滤低表达的特征（例如基因）是一个常见的步骤，但是通常选择任意阈值。Seqgate通过分析复制样本中计数的分析来实现一种合理化此步骤的方法。栅极是阈值，可以将测序特征视为确定的定量。
作者：ChristelleReynès[Aut]，StéphanieRialle[AUT，CRE]
维护者：stéphanierialle
引用（从r内，输入引用（“ seqgate”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ seqgate”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ seqgate”）
| html | R脚本 | seqgate：滤波器低表达的特征 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2.0） |
| 要看 | S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，基因组机 |
| 进口 | 统计，方法，生物管理器 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试（> = 3.0.0），EDGER，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/srialle/seqgate/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | seqgate_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqgate_1.6.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | seqgate_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqgate |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqgate |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqgate/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
