sconify
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doi：10.18129/b9.bioc.sconify
用于执行基于KNN的流量和质量细胞术数据的工具包
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包可以使用流量和质量细胞仪数据进行基于K-Near的邻居统计数据和可视化。这提供了TSNE地图“折叠更改”功能，并通过评估预期相同的FCS文件之间的歧管重叠来提供数据质量指标。与原始歧管相比，使用此软件包的其他应用程序包括插补，标记冗余和测试较低尺寸嵌入的相对信息损失。
作者：泰勒·J·伯恩斯
维护者：tyler j burns
引用（从r内，输入引用（“ sconify”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Sconify”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ sconify”）
| html | R脚本 | 数据质量 |
| html | R脚本 | Scone的最终后处理步骤 |
| html | R脚本 | 寻找理想的k |
| html | R脚本 | 一般SCONE分析 |
| html | R脚本 | 如何处理FCS文件以在R中用于下游使用 |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（4。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5） |
| 进口 | 蒂布尔，，，，dplyr，，，，fnn，，，，流核，，，，RTSNE，，，，GGPLOT2，，，，马格里特，utils，统计，readr |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | sconify_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | sconify_1.16.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | sconify_1.16.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sconify |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/sconify |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/sconify/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
