Scale4C

DOI:10.18129 / B9.bioc.Scale4C

Scale4C:一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换

Bioconductor版本:发行版(3.13)

Scale4C是一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换和可视化。尺度空间变换是一种多尺度可视化技术，通过应用不同的平滑核(高斯，增加西格玛)，将二维信号(例如在基因组选择区间上的4C-seq读数)转换为尺度空间(2D，基因组位置x尺度因子)中的镶嵌。这种转换允许对数据的结构与其他样本进行探索性分析和比较。

作者:卡罗琳·沃尔特

维护者:Carolin Walter < Carolin。沃尔特在uni-muenster.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Scale4C”)

PDF	R脚本	Scale4C:一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换
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细节

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版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 3.4)，奶昔，GenomicRanges，IRanges，SummarizedExperiment
进口	方法，grDevices，图形，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Scale4C_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	Scale4C_1.14.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	Scale4C_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Scale4C
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Scale4C
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Scale4C/
软件包下载报告	下载数据