SWATH2stats

DOI:10.18129 / B9.bioc.SWATH2stats

转换和过滤片数据统计软件包

Bioconductor版本:版本(3.16)

这个包是为了片OpenSWATH软件的数据转换成可读的格式由其他统计软件包在执行过滤、注释和罗斯福评估。

作者:彼得Blattmann (aut (cre)莫里茨Heusel (aut) Ruedi Aebersold (aut)

维护人员:彼得Blattmann < Blattmann在imsb.biol.ethz.ch >

从内部引用(R,回车引用(“SWATH2stats”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SWATH2stats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SWATH2stats”)

PDF R脚本 SWATH2stats示例脚本
PDF R脚本 SWATH2stats包装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10.0)
进口 data.table,reshape2,ggplot2、统计、grDevices图形,跑龙套,biomaRt、方法
链接
建议 testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了 MSstats,PECA,aLFQ
URL https://peterblattmann.github.io/SWATH2stats/
BugReports https://github.com/peterblattmann/SWATH2stats
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SWATH2stats_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 SWATH2stats_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64) SWATH2stats_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64) SWATH2stats_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SWATH2stats
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SWATH2stats
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SWATH2stats/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SWATH2stats/
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