StringDB

doi:10.18129/b9.bioc.stringdb

StringDB-蛋白质 - 蛋白质相互作用网络和功能富集分析

生物导体版本:版本(3.15)

StringDB软件包为String蛋白 - 蛋白质交互数据库(https://string-db.org)提供了R接口。

作者:Andrea Franceschini

维护者:Damian Szklarczyk

引用(从r内,输入引用(“ StringDB”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ StringDB”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ StringDB”)

PDF R脚本 StringDB Vignette
PDF 参考手册

细节

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版本 2.8.4
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(9年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 2.14.0)
进口 PNG,,,,SQLDF,,,,plyr,,,,Igraph,,,,rcurl, 方法,rcolorbrewer,,,,GPLOTS,,,,哈希,,,,plotrix
链接
建议 运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我 ppinfer
进口我 coexnet,,,,我是男人,,,,Netzoor,,,,杂种,,,,丽塔,,,,xina
建议我 Epinem,,,,GenEnetworkbuilder,,,,马提尼,,,,NetSmooth,,,,PCAN
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 stringdb_2.8.4.4.tar.gz
Windows二进制 StringDB_2.8.4.4.zip
MacOS 10.13(高山脉) StringDB_2.8.4.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stringdb
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/stringdb
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/stringdb/
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