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SEtools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SEtools
SEtools:用于总结实验的工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这包括一组用于使用summarizeexperiment类的工具，包括合并、融化和聚合函数。这个包中的绘图函数已经被移到了sechm包中。
作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]
维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>
引文(从R内，输入引用(“SEtools”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“SEtools”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | SEtools |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(3年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (>= 4.0)，SummarizedExperiment，sechm |
| 进口 | BiocParallel，矩阵，DESeq2，S4Vectors，data.table，刨边机，openxlsx，pheatmap统计数据,circlize、方法、股东价值分析 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/plger/SEtools |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SEtools_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SEtools_1.12.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | SEtools_1.12.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | SEtools_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEtools |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEtools |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SEtools/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SEtools/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
