SEtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEtools

SEtools:用于总结实验的工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这包括一组用于使用summarizeexperiment类的工具,包括合并、融化和聚合函数。这个包中的绘图函数已经被移到了sechm包中。

作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]

维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>

引文(从R内,输入引用(“SEtools”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SEtools”)

超文本标记语言 R脚本 SEtools
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证 GPL
取决于 R (>= 4.0),SummarizedExperimentsechm
进口 BiocParallel矩阵DESeq2S4Vectorsdata.table刨边机openxlsxpheatmap统计数据,circlize、方法、股东价值分析
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/plger/SEtools
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SEtools_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 SEtools_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) SEtools_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) SEtools_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEtools
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEtools
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SEtools/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SEtools/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网