SELEX

DOI:10.18129 / B9.bioc.SELEX

用于分析SELEX-seq数据的函数

Bioconductor版本:发行版(3.16)

基于SELEX-seq数据量化DNA结合特异性的工具。

作者:Chaitanya Rastogi,刘大红,Lucas Melo, Harmen J. Bussemaker

维护者:Harmen J. Bussemaker

引文(从R内,输入引用(“公司”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“公司”)

PDF R脚本 Motif Discovery with SELEX-seq
PDF 参考手册

细节

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版本 1.30.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(8年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 rJava(0.5 > = 0),Biostrings(> = 2.26.0)
进口 统计,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements Java (>= 1.5)
增强了
URL https://bussemakerlab.org/site/software/
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SELEX_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 SELEX_1.30.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) SELEX_1.30.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) SELEX_1.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SELEX
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SELEX
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SELEX/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SELEX/
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