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SELEX
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SELEX
用于分析SELEX-seq数据的函数
Bioconductor版本:发行版(3.16)
基于SELEX-seq数据量化DNA结合特异性的工具。
作者:Chaitanya Rastogi，刘大红，Lucas Melo, Harmen J. Bussemaker
维护者:Harmen J. Bussemaker
引文(从R内，输入引用(“公司”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“公司”)
| R脚本 | Motif Discovery with SELEX-seq | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.30.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(8年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | rJava(0.5 > = 0),Biostrings(> = 2.26.0) |
| 进口 | 统计,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | Java (>= 1.5) |
| 增强了 | |
| URL | https://bussemakerlab.org/site/software/ |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SELEX_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SELEX_1.30.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | SELEX_1.30.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | SELEX_1.30.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SELEX |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SELEX |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SELEX/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SELEX/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
