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Rqc
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Rqc
高通量测序数据的质量控制工具
Bioconductor版本:发行版(3.13)
Rqc是一种用于高通量测序数据质量控制和评估的优化工具。它对整个文件进行并行处理，并生成包含一组高分辨率图形的报告。
作者:Welliton Souza, Benilton Carvalho
维护者:Welliton Souza
引文(从R内，输入引用(“Rqc”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Rqc")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“Rqc”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 使用Rqc |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | BiocParallel，ShortRead，ggplot2 |
| 进口 | BiocGenerics(> = 0.25.1),Biostrings，IRanges、方法、S4Vectors，knitr(> = 1.7),BiocStyle，plyr，减价、网格reshape2，Rcpp(> = 0.11.6),biovizBase，闪亮的，Rsamtools，GenomicAlignments，GenomicFiles |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/labbcb/Rqc |
| BugReports | https://github.com/labbcb/Rqc/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Rqc_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Rqc_1.26.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | Rqc_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rqc |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rqc |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rqc/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
