rpsixml

doi:10.18129/b9.bioc.rpsixml

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

R接口到PSI-MI 2.5文件

生物导体版本:版本(3.15)

查询,数据结构和界面,以可视化交互数据集。此包中的PSI-MI 2.5标准,最多支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的其他数据库将连续添加。

作者:Jitao David Zhang [AUT,CRE,CTB],Stefan Wiemann [CTB],Marc Carlson [CTB],Tony Chiang [CTB]

维护者:Jitao David Zhang

引用(从r内,输入引用(“ rpsixml”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rpsixml”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rpsixml”)

PDF R脚本 RPSIXML软件包的申请示例
PDF R脚本 读取PSI-25 XML文件
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 2.38.0
在生物导体中 Bioc 2.3(R-2.8)(14年)
执照 LGPL-3
要看 方法,XML(> = 2.4.0),UTILS
进口 注释(> = 1.21.0),图形(> = 1.21.0),生物酶,,,,rbgl(> = 1.17.0),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
链接
建议 org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.dm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,org.sc.sgd.db,,,,rgraphviz,,,,ppistats,,,,Scisi,,,,测试
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com
取决于我 Scisi
进口我 Scisi
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rpsixml_2.38.0.tar.gz
Windows二进制 rpsixml_2.38.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rpsixml_2.38.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rpsixml
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rpsixml
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rpsixml/
软件包下载报告 下载统计

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