这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
生物导体版本:版本(3.15)
查询,数据结构和界面,以可视化交互数据集。此包中的PSI-MI 2.5标准,最多支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的其他数据库将连续添加。
作者:Jitao David Zhang [AUT,CRE,CTB],Stefan Wiemann [CTB],Marc Carlson [CTB],Tony Chiang [CTB]
维护者:Jitao David Zhang
引用(从r内,输入引用(“ rpsixml”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rpsixml”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rpsixml”)
R脚本 | RPSIXML软件包的申请示例 | |
R脚本 | 读取PSI-25 XML文件 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 2.38.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.3(R-2.8)(14年) |
执照 | LGPL-3 |
要看 | 方法,XML(> = 2.4.0),UTILS |
进口 | 注释(> = 1.21.0),图形(> = 1.21.0),生物酶,,,,rbgl(> = 1.17.0),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.dm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,org.sc.sgd.db,,,,rgraphviz,,,,ppistats,,,,Scisi,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com |
取决于我 | Scisi |
进口我 | Scisi |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rpsixml_2.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | rpsixml_2.38.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rpsixml_2.38.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rpsixml |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rpsixml |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rpsixml/ |
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