RolDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.RolDE

RolDE:健壮的纵向微分表达式

Bioconductor版本:版本(3.17)

RolDE检测纵向两个条件在嘈杂的high-troughput数据之间的微分表达式。甚至适合数据与适度的缺失值。RolDEis a composite method, consisting of three independent modules with different approaches to detecting longitudinal differential expression. The combination of these diverse modules allows RolDE to robustly detect varying differences in longitudinal trends and expression levels in diverse data types and experimental settings.

作者:Tommi Valikangas (cre, aut)

维护人员:Tommi Valikangas < tsvali在utu.fi >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RolDE”)

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	统计数据、方法腐烂matrixStats foreach,平行,doParallel doRNG, rngtools,SummarizedExperimentnlme,qvalue、grDevices图形,跑龙套
链接
建议	knitr、printr rmarkdown testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/elolab/RolDE
BugReports	https://github.com/elolab/RolDE/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RolDE_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	RolDE_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RolDE_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RolDE_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RolDE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RolDE
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RolDE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RolDE/
包下载报告	下载数据