此包装适用于生物导体的3.15版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅rnaseqsamples。
生物导体版本:版本(3.15)
RNASEQSAMPLASE软件包提供了一种基于负二项式模型的样本量计算方法,并提供了评估RNA-Seq数据差异表达分析的精确测试。它控制着多个测试的FDR,并利用了从真实数据的平均读取计数和分散分布来估算更可靠的样本量。它还配备了几个独特的功能,包括对感兴趣的基因或途径的估计,功率曲线可视化和参数优化。
作者:Shilin Zhao开发人员[AUT,CRE],Chung-i Li [aut],Yan Guo [aut],Quanhu Sheng [aut],Yu Shyr [aut]
维护者:shilin zhao开发人员
引用(从r内,输入引用(“ rnaseqsamplesize”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rnaseqsamplesize”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rnaseqsamplesize”)
R脚本 | rnaseqsamples:通过真实数据估计样本量 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 2.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 4.0.0),GGPLOT2,,,,rnaseqsamplesizedata |
进口 | Biomart,,,,EDGER,,,,heatmap3,,,,MATLAB,,,,keggrest,方法,grdevices,图形,统计信息,RCPP(> = 0.11.2),叙事,,,,ggpubr,,,,总结性特征,,,,花花公子,,,,dplyr,,,,tidyselect,UTILS |
链接 | RCPP |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rnaseqsamplesize_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | rnaseqsamplesize_2.6.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rnaseqsamplesize_2.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqsamplesize |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnaseqsamplesize |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaseqsamplesize/ |
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