Risa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Risa

将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:发行版(3.16)

以制表符分隔的调查/研究/化验(ISA)格式是一种通用框架，用于收集和交流复杂的元数据(即样本特征、使用的技术、所做的测量类型)，这些元数据来自使用从传统方法到高通量技术的技术组合的实验。Risa允许以ISA-Tab格式访问元数据/数据，并构建Bioconductor数据结构。目前，支持来自微阵列、流式细胞仪和代谢组学(即质谱)分析的数据。该软件包是可扩展的，正在努力支持与蛋白质组学分析相关的元数据。

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran, Audrey Kauffmann, Steffen Neumann, Gabriella Rustici, ISA团队

维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran < Alejandra .gonzalez。Beltran在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (Risa)

PDF	R脚本	Risa:将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(10.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (>= 2.0.9)，Biobase(>= 2.4.0)，Rcpp(> = 0.9.13),biocViews，affy
进口	xcms
链接
建议	faahKO(> = 1.2.11)
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.isa-tools.org/
BugReports	https://github.com/ISA-tools/Risa/issues
全靠我
进口我
建议我	mtbls2
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Risa_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	Risa_1.40.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	Risa_1.40.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	Risa_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Risa
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Risa
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Risa/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Risa/
软件包下载报告	下载数据