Ribodipa
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doi：10.18129/b9.bioc.ribodipa
Ribo-Seq数据的差分模式分析
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包对Ribo-Seq数据执行差异模式分析。它确定了两个条件之间核糖体足迹中具有显着不同模式的基因。Ribodipa包含五个主要组件，包括BAM文件处理，P点映射，数据框，差异模式分析和足迹可视化。
作者：Keren Li [Aut]，Matt Hope [AUT]，小王[AUT]，JI-PING WANG [AUT，CRE]
维护者：北西北的Ji-ping wang
引用（从r内，输入引用（“ Ribodipa”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Ribodipa”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Ribodipa”）
| html | R脚本 | Ribodipa |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（1年） |
| 执照 | LGPL（> = 3） |
| 要看 | r（> = 4.1），rsamtools，，，，GenomicFeatures，，，，基因组签名 |
| 进口 | RCPP（> = 1.0.2），图形，统计，Data.Table，，，，精英主义， 方法，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，矩阵，，，，枯萎病，，，，多帕尔，，，，foreach， 平行，QVALUE，，，，deseq2，，，，GGPLOT2，，，，Biocfilecache，，，，生物基因 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ribodipa_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ribodipa_1.4.1.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | ribodipa_1.4.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ribodipa |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ribodipa |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ribodipa/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.15的旧源软件包 | 来源存档 |
