- 首页
- Bioconductor 3.15
- 软件包
- RiboCrypt
RiboCrypt
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.RiboCrypt
基因组学的交互式可视化
Bioconductor版本:Release (3.15)
用于交互式可视化和浏览NGS数据的R包。它包含一个文本和基因组坐标视图的浏览器。此外，还包括QC和一般元图，以及微分翻译图和基因表达图。该软件包仍在开发中。
作者:Michal Swirski [aut, cre]， Haakon Tjeldnes [ctb]
维护者:Michal Swirski < Michal。在uw.edu.pl>
引文(从R内，输入引用(“RiboCrypt”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“RiboCrypt”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | RiboCrypt_overview.html |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.14 (R-4.1)(0.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6.0)，ORFik(> = 1.13.12) |
| 进口 | BiocGenerics，BiocParallel，Biostrings，data.table，dplyr，GenomeInfoDb，GenomicFeatures，GenomicRanges，ggplot2，IRanges，情节，rlang |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，rmarkdown，knitr，BiocStyle，BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/m-swirski/RiboCrypt |
| BugReports | https://github.com/m-swirski/RiboCrypt/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | RiboCrypt_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RiboCrypt_1.2.0.zip(64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | RiboCrypt_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RiboCrypt |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RiboCrypt |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RiboCrypt/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
