RiboCrypt

DOI:10.18129 / B9.bioc.RiboCrypt

基因组学的交互式可视化

Bioconductor版本:Release (3.15)

用于交互式可视化和浏览NGS数据的R包。它包含一个文本和基因组坐标视图的浏览器。此外,还包括QC和一般元图,以及微分翻译图和基因表达图。该软件包仍在开发中。

作者:Michal Swirski [aut, cre], Haakon Tjeldnes [ctb]

维护者:Michal Swirski < Michal。在uw.edu.pl>

引文(从R内,输入引用(“RiboCrypt”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RiboCrypt”)

超文本标记语言 R脚本 RiboCrypt_overview.html
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

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版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.14 (R-4.1)(0.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.6.0),ORFik(> = 1.13.12)
进口 BiocGenericsBiocParallelBiostringsdata.tabledplyrGenomeInfoDbGenomicFeaturesGenomicRangesggplot2IRanges情节rlang
链接
建议 testthatrmarkdownknitrBiocStyleBSgenomeBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/m-swirski/RiboCrypt
BugReports https://github.com/m-swirski/RiboCrypt/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RiboCrypt_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 RiboCrypt_1.2.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra) RiboCrypt_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RiboCrypt
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RiboCrypt
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RiboCrypt/
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