生物导体版本:版本(3.15)
该软件包提供了“ HTSLIB” C库的1.7版,用于高通量序列分析。该软件包主要对希望使用HTSLIB的其他R软件包的开发人员有用。bob电竞体育官网使用此软件包的动机和说明在Vignette,Vignette(软件包=“ Rhtslib”,“ Rhtslib”)中。
作者:纳撒尼尔·海登(Nathaniel Hayden
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ Rhtslib”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rhtslib”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Rhtslib”)
html | R脚本 | Rhtslib的动机和使用 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.28.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(7年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | Zlibbioc |
链接 | Zlibbioc |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | libbz2&liblzma&libcurl(带有标题文件),GNU制作 |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rhtslibhttp://www.htslib.org/ |
BugReports | https://github.com/bioconductor/rhtslib/issues |
取决于我 | |
进口我 | Deepsnv,,,,Diffhic,,,,maftools,,,,线粒体2,,,,scpipe |
建议我 | |
链接到我 | arrayexpresshts,,,,bamsignals,,,,bitseq,,,,CSAW,,,,Deepsnv,,,,差异,,,,Diffhic,,,,Epialleler,,,,火焰,,,,H5VC,,,,maftools,,,,甲基库,,,,线粒体2,,,,podkat,,,,QRQC,,,,准,,,,RFASTP,,,,rsamtools,,,,scpipe,,,,seqbias,,,,Shortread,,,,transview,,,,变体 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rhtslib_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | rhtslib_1.28.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | rhtslib_1.28.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhtslib |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rhtslib |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rhtslib/ |
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