RHISAT2
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doi：10.18129/b9.bioc.rhisat2
r包装器HISAT2 ALIGNER
生物导体版本：版本（3.15）
Kim等人的HISAT2剪接短阅读对准器的R接口。（2015）。该软件包包含包装函数以创建基因组索引并执行与生成索引的读取对齐。
作者：Charlotte Soneson [Aut，CRE]
维护者：charlotte soneson
引用（从r内，输入引用（“ rhisat2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ rhisat2”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rhisat2”）
| html | R脚本 | RHISAT2 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | GenomicFeatures，，，，sgseq，，，，基因组机，方法，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用 |
| 系统要求 | gnu做 |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/fmicompbio/rhisat2 |
| BugReports | https://github.com/fmicompbio/rhisat2/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 艾萨尔，，，，准 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rhisat2_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rhisat2_1.12.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | rhisat2_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhisat2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rhisat2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rhisat2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
